Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD5Q16401 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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