Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK3Q16288 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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