Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 BARD1-201ENST00000260947 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 HLCS-202ENST00000399120 6466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AP1G1-218ENST00000569748 4554 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PCDHGA7-201ENST00000518325 4605 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 MICAL2-201ENST00000256194 3906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 LONRF2-201ENST00000393437 13912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 LINC01588-203ENST00000529902 4279 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PANK3-201ENST00000239231 10506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 SLC26A2-201ENST00000286298 8080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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VAMP3Q15836 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 MYT1-203ENST00000536311 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 KLF8-202ENST00000374928 4821 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 NFASC-202ENST00000360049 10120 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 NFASC-225ENST00000539706 10135 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CASP8AP2-205ENST00000551025 6151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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