Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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