Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms