Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PRKAA1Q13131 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA1Q13131 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PRKAA1Q13131 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA1Q13131 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA1Q13131 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PRKAA1Q13131 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA1Q13131 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PRKAA1Q13131 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA1Q13131 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PRKAA1Q13131 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PRKAA1Q13131 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PRKAA1Q13131 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA1Q13131 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PRKAA1Q13131 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA1Q13131 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA1Q13131 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PRKAA1Q13131 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PRKAA1Q13131 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PRKAA1Q13131 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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