Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP4Q13115 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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