Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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IFT88Q13099 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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IFT88Q13099 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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IFT88Q13099 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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IFT88Q13099 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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IFT88Q13099 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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IFT88Q13099 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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IFT88Q13099 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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IFT88Q13099 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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IFT88Q13099 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT88Q13099 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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