Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LTBQ06643 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LTBQ06643 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LTBQ06643 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms