Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms