Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms