Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms