Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBASH3AP57075 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms