Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL9P32969 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL9P32969 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL9P32969 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL9P32969 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL9P32969 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL9P32969 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL9P32969 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL9P32969 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms