Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms