Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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PTPRMP28827 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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PTPRMP28827 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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PTPRMP28827 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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PTPRMP28827 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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PTPRMP28827 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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PTPRMP28827 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
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