Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AMD1P17707 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AMD1P17707 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AMD1P17707 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AMD1P17707 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms