Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYBBP04839 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYBBP04839 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms