Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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