Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFMBT1Q9UHJ3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms