Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBA6

C6orf48, Protein G8, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48Q9UBA6 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C6orf48Q9UBA6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms