Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SH3BP4Q9P0V3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SH3BP4Q9P0V3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SH3BP4Q9P0V3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SH3BP4Q9P0V3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SH3BP4Q9P0V3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SH3BP4Q9P0V3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SH3BP4Q9P0V3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SH3BP4Q9P0V3 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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