Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms