Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ELL3Q9HB65 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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