Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0G0

ZNF407, Zinc finger protein 407, humanhuman

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Length 2,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407Q9C0G0 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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ZNF407Q9C0G0 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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ZNF407Q9C0G0 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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ZNF407Q9C0G0 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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ZNF407Q9C0G0 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF407Q9C0G0 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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