Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC13A1Q9BZW2 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms