Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms