Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms