Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM7Q9BQ49 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms