Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC9

VMP1, Vacuole membrane protein 1, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMP1Q96GC9 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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VMP1Q96GC9 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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VMP1Q96GC9 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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VMP1Q96GC9 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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VMP1Q96GC9 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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VMP1Q96GC9 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VMP1Q96GC9 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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