Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms