Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC11Q96DB2 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms