Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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GTF3C6Q969F1 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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GTF3C6Q969F1 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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GTF3C6Q969F1 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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