Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms