Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms