Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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