Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms