Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FHOD3Q2V2M9 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms