Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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