Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
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RTN1Q16799 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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RTN1Q16799 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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RTN1Q16799 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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RTN1Q16799 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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RTN1Q16799 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
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