Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PCDHA9-201ENST00000378122 6900 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 UBTFL8-201ENST00000426903 2112 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 SPTB-204ENST00000389722 10063 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PXMP4-203ENST00000409299 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 SLC44A1-201ENST00000374720 10511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PTPN1-201ENST00000371621 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TP53I11-203ENST00000395648 3381 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 LGALS8-208ENST00000416919 6097 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PAX2-201ENST00000355243 4057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 RNF115-202ENST00000582693 9117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 IL21R-201ENST00000337929 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 C10orf105-201ENST00000398786 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 SCN8A-208ENST00000599343 5976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 FAM95B1-201ENST00000455995 4236 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PHF21B-202ENST00000396103 3540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 GOLGA8CP-201ENST00000446144 5237 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ALS2CL-201ENST00000318962 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 UMPS-201ENST00000232607 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 SON-201ENST00000300278 7477 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 SHANK2-201ENST00000338508 7271 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 SLC35B4-201ENST00000378509 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms