Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms