Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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