Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.5 ms