Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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