Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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NAE1Q13564 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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NAE1Q13564 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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NAE1Q13564 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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NAE1Q13564 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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