Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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C1orf61Q13536 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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C1orf61Q13536 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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C1orf61Q13536 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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C1orf61Q13536 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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C1orf61Q13536 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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C1orf61Q13536 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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C1orf61Q13536 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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C1orf61Q13536 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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C1orf61Q13536 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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C1orf61Q13536 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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C1orf61Q13536 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C1orf61Q13536 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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C1orf61Q13536 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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