Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms