Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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