Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms